Проголошення суверенітету, прийняття нових ознак державності, а особливо надання статусу державної молдовській мові та перехід на латинський алфавіт, викликали незадоволення певної, насамперед російськомовної, частини населення. Поляризація політичних сил призвела до проголошення Придністровської автономної соціалістичної республіки в складі Рибницького, Тираспільського, Бендерського та Дубоссарського районів на лівобережжі Дністра. У 1992 р. виник збройний конфлікт, наслідком якого були не тільки людські жертви і зруйновані будівлі, а й потужний міграційний потік біженців.

Економічна політика розвитку господарства в Молдові за радянських часів сприяла створенню тут підприємств машинобудівної, легкої, харчової промисловості. Для будівництва і обслуговування цих підприємств залучали людей з інших регіонів СРСР, головним чином з Росії. Це й призвело до їх концентрації в промислових центрах Бендери, Тирасполь, Рибниця та в столиці.

У господарстві Республіки Молдова провідними є агропромислове виробництво, яке базується на багатогалузевому сільському господарстві. В сільському господарстві провідна роль належить рослинництву, а в його структурі — виноградарству, садівництву, овочівництву. Виноградники й сади Молдови є неодмінним елементом ландшафту. Виноградники займають 1/4 земельних угідь країни, особливо багато їх у Код-рах. Сади поширені здебільшого в долинах річок. Під плодовими та ягідними культурами перебуває понад 7% сільськогосподарських угідь. У заплавах Дністра, Прута, на зрошуваних землях півдня поширене овочівництво та баштанництво. В країні значні посіви зернових, переважно пшениці, і технічних культур (тютюн, цукрові буряки, соняшник, ефіроолійні). Тваринництво представлене свинарством, скотарством м'ясо-молочного напряму, вівчарством, птахівництвом.

На основі інтенсивного сільськогосподарського виробництва розвивається потужний переробний комплекс, представлений виноробством, плодоовочевоконсервною, борошномельно-круп'яною, хлібопекарською, тютюново-ферментаційною, парфумерно-косметичною промисловістю.

Промисловий комплекс країни спеціалізується на машинобудуванні (сільськогосподарське, верстато-, приладобудування), легкій (шовкова, трикотажна, взуттєва, швейна, килимова), хімічній (фармацевтична, гумотехнічна) промисловості та промисловості будівельних матеріалів.

Соціально-економічний розвиток країни за роки незалежності і формування державності зазнав кризових явищ, що призвело до спаду виробництва та зниження життєвого рівня населення.

У зовнішньоекономічній діяльності переважає імпорт. Республіка Молдова імпортує головним чином енергоносії, мінеральну